元朝天主教首先派来中国的传道士是方济各会的修士孟高未诺，他于1294年到达中国，受到元世祖的信任，获准在北京建堂传道。经过十余年的努力，招收了数千个信徒，训练了几百位中国修士，1307年教皇封他为北京第一任主教。他在1305年向教皇写信，报告有六千余人受洗。由于蒙古人对汉人的残暴统治，基督教又是依靠政府的势力传教，信徒又多是外国的商人，汉人信徒极少，随着元朝的灭亡，教会也消亡。（蒙古的克烈族是信奉景教，基督教在蒙古成为"耶里可温"，蒙古语意思为：信奉福音的人 ）。

约200年后，由耶稣会利马窦（1552-1610年）重新传入中国。1601年，利马窦进驻北京，以西洋的礼品进贡万历皇帝，并对他说："上帝就是你们所指的天，曾启示孔子、孟子等，我们来不是否定你们的传统，乃是补充而已"。利马窦穿儒服研究中国经典，介绍西方科学传播福音，颇见成效，据记载清康熙年间，信徒已有十五万之多（中国通史记载30万人）。明朝礼部尚书、内阁大学士徐光启、历局监督李之藻等深受影响。皇帝康熙还写了一首诗：功成十架血成溪，百丈恩流分自西；身列四衙半夜路，徒方三背两番鸡；五千鞭鞑寸肤裂，六尺悬垂二盗齐；惨痛八垓惊九品，七言一毕万灵啼。

后来因会派之争，方济各会和道明会向教皇控告耶稣会在中国所收的信徒不是基督徒，而是孔教徒，教皇因此命令中国信徒不许称神为"天"或"上帝"，须称"天主"。同时，禁止天主教徒祭孔祭祖，此事引起康熙的不满和愤怒，遂于1700年下令，凡不遵照中国政府的法令、领取居留证的所有传道士，一律驱逐出境。据说，当时只有四位主教和一些宣道士遵命领证，其他的全部离开中国。雍正元年（1723年），皇帝即位不久便下令全国开始禁教，并驱逐西方传道士。

100年后，1807年英国伦敦会的马礼逊到达广州，将《圣经》译为汉文，又编撰了《华英字典》，对于沟通中英文化起了很大的作用。后来，随着鸦片战争、五口通商以后，大批传道士涌入中国，到了二十世纪的二十年代约有基督徒16000（天主教、基督教各占一半）。直到1949年，据说天主教有300万信徒，基督教徒70万。

中国基督教的三自爱国运动

十字架与罂粟花是同时送进中国的，马礼逊来中国是寄寓在英国鸦片商行东印度公司当职员，他的儿子马儒汉还参加过起草第一个不平等的《南京条约》。由此可见，传道士带给中国人的基督教是怎样一个形象，导致义和团运动时，有人高呼驱逐"大毛"，教案时有发生，如天津教案。1844年，《中法黄埔条约》签订，规定法国人可以在中国建立教堂，进行传道活动。1870年，在天津人们发现法国天主教堂附设的育婴堂内有30多名幼童死亡，引起民众愤怒，法驻天津领事丰大业派兵镇压，结果民众放火烧了天主堂和仁慈堂，打死外国传道士、商人和官员30人。

经此"非基运动"后，有觉悟的基督徒看出，基督徒要在中国生存，必须摘掉洋帽，成为独立自办、自养和自传的教会。1950年，从吴耀宗先生为首的40多位基督教各团体负责人联合发表《三自革新宣言》，得到周恩来总理的支持，发表在人民日报上（1950年9月23日）。半个多世纪以来，基督教在中国的发展虽然历经坎坷，但却有辉煌的成就，特别是中国大陆的改革开放以后，中国大陆现有基督教教堂4万多座（两天3座增长），近三千万信徒，《圣经》发行四千一百多万册。

福音传进福建：

福州被称为"有福之州"，第一位传教士杨顺牧师（Stechen Johnson 美部会教士）由曼谷来民，于1846年6月2日到福州；1847年3月26日,对中国开荒布道有负担，毕业于密芝根大学的柯林教士(Judson Dwight Collins), 与怀德（Moses C. White 原是纽约密尔福教堂主任牧师）夫妇与1847年4月15日，由波士顿乘"赫伯尔Heber"号大帆船到福州，行程145天。经过10年传道才得一人信主。1856年建第一堂"真神堂"。

现福建有基督徒80多万，教堂1700座，聚会点2500个，牧师300人（女100人）。有福建神学院已毕业神学生1000多人。